Le lien vers wikipedia : http://fr.wikipedia.org/wiki/Couche_limite
Dans un conduit dans lequel s'écoule un fulide, c'est la limite entre la zone où la vitesse du fulide est faible et les frottements dus à la viscosité du fulide sont important et la zone où la vitesse du fluide est importante et les frottements négilgeables.
Plus cette couche limite est mince, moins il faut d'énergie au fulide pour se déplacer (c'est mieux).
Le fait de laisser des aspérités dans un conduit "aurait tendance" à réduire l'épaisseur de la couche limite.
Comme la viscosité des gaz dans un moteur est faible et que les divers conduits sont plutôt courts, ça ne doit pas avoir trop d'influence. Surtout qu'il y a plein d'autres paramètres qui entre en jeu!